El grupo de Biología de Sistemas en Interacciones Microbiota-Hospedador ofrece una plaza de Bioinformático/a (Personal técnico de investigación, licenciado/a T3) para contribuir a las distintas líneas de investigación del grupo.

La persona seleccionada realizará diferentes tareas enmarcadas en dos proyectos:

• PID2022-139948NA-I00 (Caracterización de la variación transcripcional microbiana y sus fuentes en el ecosistema intestinal) con un 60% de dedicación:

o Participación en el desarrollo de pipelines computacionales y métodos estadísticos para el análisis de datos de     metatranscriptómica en muestras con baja carga microbiana.

o Meta-análisis de datos públicos de RNA-seq, metagenómica y metatranscriptómica.

o Análisis de microbiota de muestras intestinales mediante la técnica de secuenciación de 16S o metatranscriptómica.

• ERC StG 2023 101116482 (Transcriptional REGUlation as a mediator of bacterial interactions in the microBIOME) con un 40% de dedicación:

o Participación en el desarrollo de pipelines computacionales para el análisis a gran escala de datos de transcriptómica de bacterias.

o Análisis bioinformáticos de transcriptómica de bacterias, así como metagenómica y metatranscriptómica de diferentes tipos de muestras.

Además de estas tareas específicas, la persona contratada participará en la preparación de artículos científicos y será responsable del manejo de datos de los diferentes proyectos

EL CV DEBE SUPRIMIR TODA REFERENCIA PERSONAL: NOMBRE, SEXO, EDAD, ESTADO CIVIL, NACIONALIDAD Y NO DEBE INCLUIR FOTOGRAFÍA.

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The Systems Biology of Host-Microbiota Interactions lab is offering a position for a Bioinformatician (technical research staff, graduate T3) to contribute to the different research lines of the group.

The selected candidate will develop various tasks within two of our funded projects:

• PID2022-139948NA-I00 (Characterization of the microbial transcriptional variation and its sources in the gut ecosystem) with 60% dedication:

o Participation in the development of computational pipelines and statistical methods for the analyses of metatranscriptomics data in samples with low microbial biomass

o Meta-analysis of public datasets of RNA-seq, metagenomics and metatranscriptomics

o Analysis of microbiome in intestinal samples using 16S amplicon sequencing and/or metatranscriptomics

• ERC StG 2023 101116482 (Transcriptional REGUlation as a mediator of bacterial interactions in the microBIOME) with 40% dedication:

o Participation in the development of computational pipelines for the analysis of large-scale bacterial transcriptomics experiments

o Data analyses of different types: bacterial transcriptomics, metagenomics and metatranscriptomics of different sample types.

Beyond these specific tasks, the selected candidate will participate in the preparation of scientific manuscripts and will be responsible for the data management of different projects.

THE CV SHOULD REMOVE ALL PERSONAL REFERENCES: NAME, GENDER, AGE, MARITAL STATUS, NATIONALITY AND SHOULD NOT INCLUDE A PHOTOGRAPH.